Gran Órgano (I):
violón 16’, flautado 8’, violón 8’,
flauta armónica 8’, octava 4’.

Recitativo (II):
cor de nuit 8’, viola de gamba 8’, voz celeste,
flauta octaviante 4’, tiple dulce 2’, contrafagot 16’,
trompeta 8’, fagot-oboe 8’, voz humana 8'.

Pedal:
contras 16’, contras 8’.

I/P, II/P, II/I, Octavas agudas I/I, expresión al II, trémolo, fuertes de trompetería, fuertes de flautados.

Consta de dos teclados de 56 notas y pedalero de 30.
La 4: 430 Hz. Temperamento igual. Transmisión mecánico neumática de teclados, neumática de registros.

 
     
 
Órgano construido por Lope Alberdi en el año 1917. En 1986 el organero Iñaki Oyarzabal añade un registro de lleno al gran órgano y en 1994 es sustituida la ocarina del recitativo por una flauta de 2’. Restaurado en el año 2010 por el taller de organeros Späth de Suiza y reinaugurado por el organista Benantzi Bilbao el 29 de junio del mismo año.